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棉花所開放棉花資源和基因數據共享

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  12月31日,由中國農業科學院棉花研究所生物信息與分子設計中心構建的棉花資源和網絡數據庫網站(http://grand.cricaas.com.cn)正式上線。用戶可在該網站上進行數據挖掘和分析、可視化展示等,操作簡單快捷,結果準確易懂。

  該數據庫網站(Gossypium Resource And Network Database,GRAND)目前主要功能有:棉花SNP變異和Indel變異,基因組注釋信息以及基因家族信息的可視化瀏覽、多重標準檢索,比較檢索,基因檢索,Marker檢索以及表型性狀檢索等多種檢索功能、引物設計、表達譜展示、數據下載與上傳等。目前該數據庫只是第一版本,后續將開發更多功能。

  近年來,棉花所先后完成了二倍體雷蒙德氏棉(D基因組)、二倍體亞洲棉(A基因組)及四倍體陸地棉(A/D組)全基因組測序及圖譜繪制工作,在棉花基因組測序領域占據國際領先地位。GRAND數據庫網站整合和挖掘了棉花所完成的棉花全基因組測序數據及其他相關轉錄組數據,并向全球開放,為棉花科研人員提供了便利,將極大地促進棉花分子育種以及棉花其他分子生物學方面的研究,提升棉花所在全球的科研地位和影響力。(通訊員  梁冰)

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